1831 : la Savoie n’est pas encore française, les frères arrivent à Thonon. Les premières classes sont installées place de l’école (actuellement place Henri Bordeaux) puis l’école se transporta Rue Chante Coq.
1838 : les Frères ayant acheté une partie de l’ancien couvent des Ursulines s’y installèrent en 1839.
1841 : arrivée du Frère Alman
1860 : la Savoie devient « française ». A cette époque le pensionnat St Joseph de Thonon compte 140 élèves.
1913 : la Municipalité refuse de prolonger le bail et décide l’expropriation de toute la propriété des la rue des granges. Le terrain dit « les contamines », à gauche de la route d’Evian, est acheté, on y construira dans un temps record l’Institution Libre Saint Joseph et la rentrée peut avoir lieu le 5 janvier 1914. Dans le même temps, sur un terrain propriété de la Société Civile Immobilière, l’Ecole libre Saint François sera construite dans des délais eux aussi très courts. La rentrée peut se faire le 17 novembre, les 144 élèves étant répartis en trois classes dans le bâtiment à galeries. Sous sa fraternelle et sage direction, cette seconde Institution Saint Joseph, bien aménagée, tenant compte de toutes les prescriptions hygiéniques modernes, prit un rapide essor, malgré la Grande Guerre qui avait appelé sous les drapeaux plus de la moitié de ses professeurs.
1920 : le Frère Valéric-Alphonse (ALPHONSE Poncier) est nommé directeur de l’institution St Joseph.
1933 : construction de la chapelle.
L’établissement accueillait plus de 300 élèves pris en charge par une bonne vingtaine de Frères avec des « professeurs civils » de plus en plus nombreux.
1936 : Création de la société « Les Gars de St Jo » toujours bien vivante.
1939-45 : mobilisation d’une dizaine de Frères. Le 12 décembre 1943 les autorités allemandes réquisitionnent « St Jo » pour en faire un hôpital militaire.
Les classes doivent émigrer au groupe des Suets. Une situation difficile qui se prolongea jusqu’au 13 août 1944.
1945 : la Paix revenue, le Frère Alphonse Poncier est nommé visiteur de Savoie tandis que Frère Valéric (Henri Géry) devient le 5ème directeur du pensionnat. Il le demeurera jusqu’en 1959.
Après les « événements de mai 68 » qui ont secoué le monde étudiant, on prend au sérieux l’idée de faire craquer toutes les structures anciennes pour faire du neuf par la mise en commun par
tous les Etablissements d’Enseignement Catholiques de Thonon,
de l’ensemble de leurs ressources en maîtres, locaux et énergies de toute nature et
l’organisation d’une « communauté Educative constituée par les responsables de l’éducation des jeunes :
l‘E.C.T est créé. L’Institution St Joseph en fait partie comme Etablissement secondaire.